关于小龙虾体内存在的病毒，已经有大量的研究报道。在各种小龙虾体内中存在的多种病毒，部分病毒是可以导致包括对虾在内的其他水生动物的大量死亡的致病性病毒。到现在为止的研究结果，只证实了白斑综合征病毒（WSSV）能引起小龙虾的病毒性疾病，其他的病毒尚未证实是否会引起人工养殖小龙虾疾病的大范围流行。不过，已经完成的实验性研究结果证明部分种类的病毒对小龙虾是具有高致病性的，在这部分高致病性病毒中就包括了已经引起世界范围内对虾养殖业巨大损失的WSSV。到现在为止，从小龙虾体内发现的病毒有：属于脱氧核糖核酸（DNA）和推定的脱氧核糖核酸（DNA）病毒，主要有属于核内杆状病毒（类杆状病毒）：如小龙虾杆状病毒、蓝魔虾杆状病毒、贵族螯虾杆状病毒等。属于核糖核酸（RNA）和推定的核糖核酸（RNA）病毒，主要有呼肠孤病毒：如澳洲红螯螯虾肝胰腺呼肠孤样病毒（CqHRV）等。尚未确定分类地位的病毒有两种：贵族螯虾鳃上分离的一种病毒和蓝魔虾中分离的一种病毒。小龙虾出现的大量死亡问题主要表现为：虾活动减少、无力上草、摄食减少、体内出现积液、头盖壳易剥离、肝胰腺颜色变白，死亡量迅速上升等症状或现象。通过实验室PCR分子检测病毒，确认是白斑综合征病毒感染所致。小龙虾绝大部分种苗的体内携带了病毒，早期病毒量极低，虾正常；随着养殖时间的延长、温度的上升、水环境的恶化、饲料摄入量的增加以及营养不全面、虾抵抗力下降、虾体内病毒大量增殖、水体中病毒病原和致病菌数量迅速增加、病死虾被摄食致传播病毒感染加剧，形成暴发病，导致虾大量死亡。防控方法：（1）改善水质，确保水环境稳定；（2）投喂全价饲料，添加抗病毒中药（纯天然植物复配而成，可高效抑制病毒的复制增殖）或者免疫促进剂（小肽类非特异性免疫增强剂，能有效抑制病毒的繁殖）的饲料；（3）切忌高温期间或温度变化期间过度投喂；（4）保持水深，注意水温剧烈变化而引起温度应激；（5）水体消毒杀灭病毒，采用聚碘溶液全池泼洒，每立方水体0.3～0.5毫升，连续2～3次，隔天一次；（6）避免捕捞小龙虾时过度干扰小龙虾，以免惊吓引起应激；（7）注意放养密度，密度应激是小龙虾短时间大量死亡的重要原因之一，包括捕捞时地笼内的小龙虾极易在很短时间内发生死亡都是密度应激造成的。药物治疗方法：非特异性免疫增强剂对小龙虾白斑综合征治疗效果显著。采用在饲料中添加内服的方法，连续投喂5～7天即可。无害化处理方法：白斑综合征病毒传染性极强，死亡虾或病毒污染水体可迅速传播疾病，尽可能捞出病死虾，切忌将患病虾池水排入进水沟渠。