A型流感病毒在保育猪群的感染和传播
A Diaz1, M Torremorell1 , C Corzo2, M Culhane1, S Sreevatsan1,
1.兽医群体医学部,兽医学院,明尼苏达大学,St. Paul MN, USA;
2.PIC 纳什维尔 TN
前言
A型流感病毒(IAV)有一个分段基因组,负链RNA,8个基因片段翻译成12种不懂的蛋白质。流感呈世界性分布,并可以感染多种动物,包括人类,它在同种动物间和异种动物间的流行病学都非常复杂,许多信息至今未被人类了解(1)。猪被认为是A型流感病毒的混合器,但是对于它在地方性被感染猪群的演变、流行和发病率知之甚少。本次研究的目的是描述在后断奶期IAV在猪中的感染和传播特性,为了鉴定IAV在猪群持续存在的决定因素。
材料和方法
来自2200头3周龄的132头猪被随机挑选和标记,并送达一个商业从断奶到出栏的生长猪场。实验室检测显示猪群已经被IAV感染。在抵达目的地时每头猪都要采集鼻拭子,大约需要15周。每个样品都用RT-PCR检测IAV。用数周时间对比IAV的传染流行和每种动物再次感染的风险。此外,抵达目的地时采集血清样品,然后每隔4周采集血清样品,用ELISA检测IAV抗体,用t-检验比较实验结果,P<0.05在统计上被认为差异显著。最后,每周挑选阳性样品并用RT-PCR检测,鉴定病毒亚型(H1N1,H1N2,或者H3N2),在挑选的断奶猪群中循环操作。
结果
在抵达目的地时132头猪里面有6头猪检测阳性(4.5%)。全程流行率为75%,每周的流行率从0%-39.4%排列(P<0.05)。我们鉴定了2个IAV发病率高峰,断奶后2周和7周,分别的流行率为39.4%和24.5%。通过PCR检测不连续数周的样品显示抗体检测阳性的29%的猪被感染,认为可能是通过猪对猪的直接接触传播,甚至是早期已经感染。关于血清学的结果,0、4、8和12周的样品平均值和标准方差阴性率(S/N)分别为0.550 (0.227), 0.695 (0.186), 0.191 (0.109), 0.224 (0.1426)(p<0.05),显示由于主动感染导致后来在血清转化在母源抗体衰减之后。最后,至少在断奶后6周我们用RT-PCR还可以检测到同样的IAV片段(H1N1),而且5周后检测到一株H3N2表明断奶后IAVs 的传播和猪群中持续存在是复杂的和呈动态变化的。
结论和讨论
总结我们的结果可以看出,IAV可以保持在生长猪群低水平的流行,而且感染可以在早期免疫猪群中发生。我们推测流感病毒在猪群中群体低水平的持续存在部分是因为猪的再感染能力,猪的再感染能力取决于病毒变异和猪的抗体水平高低。此外,我们证实IAV在地方性感染猪群流行在断奶后数周有明显的变化。
致谢
国家猪肉委员会(NPD),明尼苏达超级计算机研究所(MSI)和明尼苏达大学生物学基因组中心(BMGC).
参考文献
1. Taubenberger JK, Kash JC. Influenza Virus Evolution, Host Adaptation, and Pandemic Formation. Cell Host & Microbe. 2010;7(6):440-51.
2. Hass J, Matuszewski S, Cieslik D, Haase M. The role of swine as "mixing vessel" for interspecies transmission of the influenza A subtype H1N1: A simultaneous Bayesian inference of phylogenyand ancestral hosts. Infection Genetics and Evolution. 2011;11(2):437-41.
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