美国猪群中汉普森短螺旋体的分布和多样性
前言
自2000年底,报道北美猪群暴发的痢疾引起重大的经济损失。从粘液出血性腹泻病例中分离的汉普森短螺旋体,是一种新的强溶血性物种,与猪痢疾短螺旋体引起腹泻在临床上不易区分。新的致病性汉普森短螺旋体由2感染不同进化枝组成(I和II),美国猪场中进化枝I分离率较高1。2个进化枝基因型的多样性和流行病学意义仍未知。因此,本研究目的使用多位点序列分型(MLST),描述汉普森短螺旋体在美国猪群流行特征,调查它们分布,相关性和流行病学。
材料和方法
依据6个管家基因,用以前计划MLST的引物得到的4个短螺旋体基因(est,glpK,pgm和thi)2和源于最新发展2个基因(adh和gdh),建立一种新的MLST方案。在2009-2013年,源于美国5个主要养猪州,13个系统,25个位点分离40株汉普森短螺旋体(28进化枝I和12进化枝II),由明尼苏达州大学兽医诊断实验室收集培养的,作为初步样本。这些分离株通过MLVA3个水平(位点内,位点外/系统内,系统外)描述和分析。PCR条件:95℃初步变性15min,接着94℃ 30sec,48℃ 1min和72℃ 1min进行35个循环,最后72℃延伸10min。比较分离菌株核苷酸序列的每个位点,确定等位基因数量。接着依据等位基因组合基因序列类型(ST),描述分离菌株,将克隆STs分到克隆混合物中(CCs)。串联核苷酸序列用于评价美国2种进化枝基因型相关性。
结果
图1 UPGMA(费加权组平均法)树状图描述11个汉普森短螺旋体STs的分子相关性。每个串联序列长度为4113个核苷酸,并且规模总长度表现为核苷酸每1000个碱基对有25个替代碱基。
评价汉普森短螺旋体分离株代表的11个STs(4个进化枝I和7个进化枝II)和3个CCs(1个进化枝I和2个进化枝II)(图1)。每个位点发现不超过1个ST,并且一般说来,不同位点由一个系统共享一个普通ST。许多年以后,发现汉普森短螺旋体阳性的位点和系统久而久之也感染相同STs。仅仅发现一个系统分离株多于一个进化枝,然而,系统内,每个进化枝有特异位点。
结论及讨论
我们发现汉普森短螺旋体基因型的流行病学与其起源的位点和系统相关。暂时的,在一个位点检测出相同基因型,尽管历史上明显成功清除汉普森短螺旋体,表明从系统内来源有可能进行再次感染。从这些初步研究,美国汉普森短螺旋体进化枝II比进化枝I显示出更多基因型多样性。这是首次研究,猪群中汉普森短螺旋体基因型传播,并阐明其流行病学和相关性。
致谢
我们感谢明尼苏达州大学兽医诊断实验室提供的汉普森短螺旋体分离株。
参考文献
1. Chander Y et al. 2012. Journal of Veterinary Diagnostic Investigations 24(5):903-910
2. Rasback T et al. 2007. Microbiology 153(12), 4074-4087
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