猪肺炎支原体在猪生产系统中的变异性
前言
由猪肺炎支原体引起的流行性肺炎成为全世界养猪业巨大的经济问题。尽管该病借助疫苗预防和抗生素治疗得到一定改善，但防控仍具有挑战性。已经报道过猪肺炎支原体遗传变异性。从历史上看，我们发现猪肺炎支原体的特征性情况在临床症状和治疗效果有巨大改变。假设猪肺炎支原体遗传变异性存在生产体系中。本研究旨在描述生产体系中猪肺炎支原体的变异多样性。
材料和方法
选择PRRS阴性并感染地方性支原体、保育到育肥3个阶段的猪作为样品。保育猪来自8个母猪场，这8个场的所有种猪引自同一个繁殖场，种公猪精液也获取自同一个体系。8个栏舍的猪只来自同一个母猪场;其他栏舍的混有2-4个猪源。采集22个栏舍共计130头4-5月龄猪的气管抽取物和支气管棉拭子。现场不论死因的猪采集支气管棉拭子。表现干咳猪的口咽管到气管提供负压，采集气管抽取物。样品用特异性RT-PCR在UMN VDL上定量，然后用MLVA(多位点串联重复序列)类型分析修改定型。MLVA定型依据猪肺炎支原体两个基因座(P97和P146)上VNTRs(重复序列)的数量，Dos Santos等人曾在文献中进行报道过。MLVA结果使用Bionumerics®(生物信息分析)进一步处理，并创建系统树图了解猪肺炎支原体与生产系统之间关系。
结果
共分析95份样品。确定4种独特的猪肺炎支原体变异型(9-15，11-21，9-21和7-15)[图1];变异型命名表明2个基因座上重复数量，即P97和P146。最为普遍的变异型为9-15，通过标准RT-PCR检测到79%栏舍中61头猪为阳性，并确定在所有的3个位点上。变异型11-21，在37%栏舍中26头猪为阳性，在位点1和位点2上;变异型7-15，在2个栏舍(占11%)中7头猪为阳性。栏舍1的所有分离株均为变异型7-15，以及其他栏舍分离的1株，在位点1上。从1个栏舍中单独分离到1株变异型9-21，在位点2上;所有栏舍其他样品分离为变异型11-21。
结论及讨论
本次研究鉴定4种变异型，显示出有限变异;这可能是因为采样位置和采集样品数量太少。还没有设计检测母猪源变异的模型。在MLVA位点上重复的相似性见图1，变异型7-15可能是变异型9-15的一个位点突变引起。我们也能做出相似假设：变异型9-21样品可能是由于变异型9-15和11-21位点重组得到的。分析临床症状和发病率/死亡率，对于确定疾病增加或减少与观察到变异型之间的相关性是有必要的。这是美国生产系统第一次用MLVA鉴定并报道遗传变异性;本次观察到的遗传变异性与欧洲养殖场报道结果有相似性。
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