俄罗斯与巴基斯坦的关系也经历了几个发展阶段。

第一阶段从1948年至1954年两国算是处于非敌非友的模糊状态。1948年5月1日，两国正式建立外交关系。但是，当时苏联并没有对巴基斯坦表示出支持，反而是持中立观望的态度。主要原因在于，1947年至1953年间，巴基斯坦主要奉行不结盟的外交路线。直到1949年5月尼赫鲁宣布将于1950年10月访美，同时宣布印度将会继续留在英联邦里，这两个事件让苏联判断印度外交将可能更加倾向美欧。作为反制措施，苏联立即邀请巴基斯坦总理利雅卡特·阿里·汗，但是苏联却一直未能确定下利雅卡特·阿里·汗最终的访问日期。相反，1949年12月，巴基斯坦宣布总理将于1950年5月访问美国。之所以巴基斯坦选择倾向美国，主要基于意识形态的可能对立，以及认为苏联不可能大量援助巴基斯坦。

第二阶段是1954年至1965年是苏联和巴基斯坦逐步形成二极敌对的阶段。 1954年巴基斯坦加入美国主导的《东南亚条约组织》 ，1955年加入《中央条约组织》。1957年7月，美国总统艾森豪威尔拜托巴基斯坦总理侯赛因·沙希德·苏拉瓦底允许美国在巴基斯坦境内建设秘密情报机构的据点，以及能供U-2侦察机起降的基地。最后巴基斯坦决定于距白沙瓦市区16公里远处建设白沙瓦空军基地，整个建筑由美国国家安全局管辖，内并有一架巨大的通讯消息拦截器。这些清晰地显示巴基斯坦已经逐步加入到美欧阵营。为此，苏联也逐步选择了亲印政策，支持克什米尔属于印度的立场。1960年的U-2飞机事件严重地伤害了苏联和巴基斯坦的关系，苏联甚至威胁轰炸这一秘密基地。到1965年印巴第二次战争时，苏联开始成为印度最大的武器供应国，而此时的印度也已经远离了美欧，冷战的两极对立在南亚完全形成。

第三阶段是1965年至1991年苏联解体，双方整体上一直保持着敌对状态，只是巴基斯坦不同政府上台后使得敌对程度略有差异，期间两国关系也略有缓和。1971年第三次印巴战争时，正是由于苏联与印度签订的《和平友好条约》，才让印度可以大胆支持孟加拉独立。1971年的战争之后，巴基斯坦主动缓和同苏联的关系，最终1974年布托总理对苏联进行了访问。可以说，1973-1979年间苏联和巴基斯坦关系在不停地改善。然而，到1979年苏联入侵阿富汗后，巴基斯坦又站在了反对苏联的最前沿。美国、巴基斯坦、沙特等国给反抗武装提供了大量军事援助，以反抗苏联支持的阿富汗傀儡政权。

第四阶段是1991年迄今，两国关系逐步开始克服各种障碍而逐步改善。20世纪90年代，由于巴基斯坦支持阿富汗塔利班而使两国关系无法大幅改善。1998年印巴核试验时，俄罗斯并没有批评巴基斯坦，由此导致巴基斯坦总理谢里夫在时隔25年后对俄罗斯进行了访问，但是却并没有带来大的突破。2001年美国发动阿富汗战争，巴基斯坦改变政策支持美国的反恐政策，由此也带来俄罗斯与巴基斯坦两国关系中的障碍被削弱。

2011年俄罗斯表示要改变对巴政策，支持巴基斯坦加入上合组织。2012年普京甚至称要访问巴基斯坦，但是随后却取消了这一访问。然而，近年来两国关系不断走近，尤其是2016年9月，就在印度发动“孤立”巴基斯坦行动时，俄罗斯与巴基斯坦却在9月24日正式举行双方首次联合军事演习“友谊2016”，尽管规模很小，但是首次联合军演的时机却显示了两国逐渐发展的双边关系。

未来，俄罗斯同巴基斯坦的关系仍可能继续改善。尽管印度是俄罗斯在南亚的首要伙伴，但是随着印度经济实力已经超过俄罗斯，并且印度同美国的防务合作越来越近。俄罗斯选择加强同巴基斯坦的关系，也是完全符合道理的。